這一時期，還出現了一些高水平的醫學全書，其中享有盛名而至今仍為醫家推崇的則數張介賓《景岳全書》為最。

清朝是我國最后一個王朝。這一時期，祖國醫學的最大成就，是形成了與傷寒學說相羽翼而又有相對獨立性的新理論——溫病學說，從而豐富了祖國醫學對于外感熱病治療的手段和經驗。其時葉天士著《溫熱論》，薛生白著《濕熱條辨》，吳鞠通著《溫病條辨》，王孟英著《溫熱經緯》，洋洋灑灑，蔚為大觀。

溫病學說之外，王清任《醫林改錯》和吳尚先《理瀹駢文》，也在中醫學發展中各樹一幟。王清任注重實踐，不僅在解剖學及研究醫學的方法論方面做出了可貴的貢獻，而且還創造了許多活血化瘀和益氣活血的方劑，擴大并深化了祖國醫學對于瘀血病癥的認識和治療。

吳尚先的創新精神在于從理論和實踐上，對古代外治法進行了系統的繼承和發揚，使這一簡、便、廉、驗的治療方法，得到了廣泛的推廣和應用。

民國以來，隨著西洋醫學的源源輸入，自清代形成的中西醫匯通思潮有了進一步的發展。其時出現的衷中參西學派，為中西醫互相取長補短，做出了有益的探索，并使中西醫匯通的思想和學

留下了輝煌的一筆。這一時期，由于戰亂頻繁，疫癘及外傷等疾患盛行，因此，著眼于簡便廉驗的實用急救方書和外傷科醫書便應運而生。比較著名有葛洪術內容，作為中醫事業發展的一個重要方面，逐漸滲透到中醫各科臨床、教學和書刊中，成為現代中西醫結合研究的先行。

歷史上的中醫學，一直是以民間的研究和發展為主流，政府實際對于醫學的研究并沒有起到主導作用，這為中醫的學派形成、治療技術方面的多樣化創造了好的外部條件。但是，利弊相兼，中醫學的研究和發展，也始終沒有得到政府的重視，在僵化的人文社會環境下，作為自然科學一部分的醫學甚至受到壓制，一批社會精英不愿從事醫學，直接導致清末封建王朝解體之后祖國醫學一蹶不振，如形骸獨立。