秦漢時方仙道的影響較深，秦代的茅蒙，漢代的張良習服食辟谷、王仲都修煉御寒暑功夫，多有神秘色彩，東漢道教興起后，為了在民間發展教徒，也多采用醫藥作為手段。《太平經》中對煉氣、眼藥、針灸等也有記述，大量吸收醫藥知識為宗教活動服務。

　　秦漢時期的具有唯物主義思想的學者及其學派，對于破除神仙宗教的迷霧，正風俗、美教化、促進科學文化事業發展發揮了良好作用，漢初陸賈指出：“人不能懷仁行義，分別纖微，忖度天地，乃苦身勞形。入深山，求神仙，棄二親，捐骨肉，絕五谷，廢詩書。背天地之寶，求不死之道，非所以通行防非者也。”東漢時王充，在《論衡》中有多篇論及天人關系、神形關系、醫藥史事、衛生保健、疾病防冶，以及改變不良衛生時尚等等，在王充所處的時代，宗教意識泛濫，僅漢光武帝二年（公元26年）“初制效兆于洛陽城南”時，所祠諸神多達1514種，至漢章帝時這種風氣更盛，在這樣的文化氛圍中，王充力匡時敝，批判神仙說、骨相說、以及感生巫術、迷信禁忌、不求實際的擇時擇地等，闡述富有哲理而又科學的醫學見解，認為人壽命的長短與稟氣薄厚有關，并非命定。“稱赤松、王喬好道為仙，度世不死，是以虛也。”“圖仙人之形，體生毛，臂變為翼，行于云，則年增灸，千歲不死，此虛圖也。”