這些本草專著是一脈相承的。雖然在卷數、藥物數量、注釋及相關內容方面歷代都有發展和增加，但在總的體例、分類、編排方式等，仍與《神農本草經》相同。可以說后世有關本草著作都是在其基礎上發展起來的。“序文”發展為后世本草的“敘例”，三品藥物發展成為后世本草的各類及分卷，藥物條文保留在《證類本草》及各本草書中。今日所見《證類本草》的“白文”，既是《神農本草經》的古文獻，也是陶弘景的“朱文”。

南朝齊梁時代的陶弘景沿用《神農本草經》原有分總論、各論的體例，把總論部分增補并加以注釋，為成《本草經集注》卷一序例。各論部分除了將《神農本草經》不同版本的藥物種類確定為365味，從《名醫別錄》中也選用藥物365味，合計730味，并按他自己的見解予以注解，這就是《本草經集注》后6卷的內容。730味藥物按玉石、草木、蟲獸、果、菜、米及有名無用分為七類，除后者外，前六類均尊古法分為上、中、下三品。可見藥物的資料源是由古本《神農本草經》、《名醫別錄》及陶弘景的注釋三部分構成。陶弘景為了讓讀者和后人能區分兩個不同資料源的內容，特地采用朱、墨雜書的方法，以紅字朱文書寫《神農本草經》，以黑字墨文書寫《名醫別錄》。這對保存、標記、識別《神農本草經》原來面目有著非常重要的價值，這也是唐代《新修本草》、宋代《證類本草》得以見到《神農本草經》內容真目并為之仿效(《證類本草》緣鏤版印刷而變通為“白文”和“黑文”)。

唐初蘇敬《新修本草》是由《本草經集注》和《藥圖》、《圖經》三部分組成，《神農本草經》的內容是正文、是主體，《藥圖》是當時全國各地選送的藥物標本繪畫而成，《圖經》是藥圖的文字說明，其主體內容沿用了陶弘景的體例和方法。在藥物數量上增加了114種，由于將《神農本草經》中的數味藥物(如“由撥”與“鳶尾”)進行了分條，所以其中所載藥物為850種。在藥物分類上，將原有的“草木”“蟲獸”分解為“草、木、獸禽、蟲魚”而成為九類分法，極個別藥物在原有類別中作了調整�！缎滦薇静荨穼λ幬镔Y料來源也仿照陶弘景的思路而采用大、小號字的辦法予以標記。凡陶弘景注文用小字書寫，而新增注文不但用小號字書寫還冠以“謹案”予以區別。

北宋馬志等人在《新修本草》的基礎上，經過兩次修訂，著成《開寶重定本草》(即《開寶本草》)(公元974年)，沿用蘇敬的9類分法，新增藥物133種，載藥為983味。《開寶本草》的正文用大字單行，注文小字雙行。正文出于《神農本草經》者印成白文，出于《名醫別錄》印成黑文，出于《新修本草》則在文末加注“唐附”，出于《開寶本草》新增者于文尾加注“今附”。

《開寶本草》問世數十年后，掌禹錫等完成了《嘉祐補注神農本草經》，簡稱《嘉祐本草》(公元1057～1061年)。其分卷、藥物分類、編寫體例、文獻出典等，完全依照《開寶本草》，共21卷，載藥1082種。其中983種承襲《開寶本草》所載的全部藥物及內容，新增99種，唯文獻來源的標記方式略有區別。凡正文出于《神農本草經》者印成“白文”，出于《名醫別錄》者印成黑字，出于《新修本草》補充的內容用“唐本先附”標記，