1.抑制蛋白酶的作用：創傷、感染等引起的應激時，體內蛋白水解酶增多，過多的蛋白水解酶可引起組織的損害。AP蛋白中有蛋白酶抑制物，例如α1-抗胰蛋白酶、α1-抗糜蛋白酶、C1酯酶抑制因子、α2-抗纖溶酶等。應激時，這些酶的消耗增加，同時合成也增加，以保證蛋白酶抑制物能得到必要的補充。

　　2.凝血和纖溶纖維蛋白原：在凝血酶作用下形成的纖維蛋白在炎癥區組織間隙構成網狀物或凝塊，有利于阻止病原體及其毒性產物的擴散;繼而纖溶系統的激活又可在晚些時候溶解這些凝塊而使組織間隙恢復原狀。然而，凝血和纖溶系統的過度激活卻有可能導致DIC而給機體造成嚴重的后果。

　　3.清除異物和壞死組織：某些AP蛋白具有迅速的非特異性的清除異物和壞死組織的作用。例如C-反應蛋白容易與細菌細胞壁結合，又可激活補體的以經典途經，促進大、小吞噬細胞的功能。這就使得與C-反應蛋白結合的細菌迅速地被清除。

　　4.清除自由基：如銅藍蛋白能活化超氧化物岐化酶，故有清除氧自由基的作用。

　　5.其他：如血清淀粉樣物質，A可能有促使損傷細胞修復的作用;纖維連接蛋白則能促進單核細胞、巨噬細胞和纖維母細胞趨化性，促進單核細胞膜上Fc受體和C3b受體的表達，并活補體旁路，從而促進單核細胞的吞噬功能等等。

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