胃食管反流病是食管賁門抗反流防御機制下降和反流物對食管黏膜攻擊增強的結果？人體在成長過程中，開始進食時都有反流，如嬰兒喝完奶后都會反嘔，有經驗的媽媽會將寶寶抱直拍拍后背讓奶水順利流入胃腔中。嬰兒胃酸很少，雖然喝奶后胃內容物隨奶水反流入食管甚或口腔，但反流物是奶水不會造成對食管粘膜的損害。成長過程中，胃腸道的蠕動也是一種馴化過程，慢慢形成了一種單行道，進食后食物只能往往胃腔、小腸方向走，不會逆蠕動走，如果長大后還是出現亂走的現象，就是胃腸功能紊亂，在食管就會引起反流病。一般人理解在食管下端和胃腔相連處有道“門”稱之為賁門，這扇門只容許食物從食管進入胃，而阻止胃內容物由胃進入食管，這樣就有效地防止了胃酸對食管粘膜的破壞，如果沒有了這道門（如胃手術后）或這扇門損壞了，就失去了把門功能容易造成胃食管反流。Barrett食管、食管裂孔疝就容易造成這扇門損壞，從而易導致胃食管反流病的發生。

其實食管胃之間雖然有賁門，但并不是真正的“門”，它是由包繞著食管下端的肌肉構成稱食管下括約肌（LES）。正常情況下LES呈繃緊狀態，造成該外食管腔內的壓力超過胃內壓形成高壓帶，可防止胃內容物反流食管？當LES壓力降低、腹內壓升高使隔壓差增加可誘發胃食管反流的發生？其中，一過性LES松弛（TLESR）在發病中起重要作用。此外，裂孔疝？胃排空延緩、食管蠕動障礙或清除功能下降等也與NERD的發生有關？部分病例還與食管敏感性升高和精神？心理障礙有關？本病雖屬一種酸相關性疾病，但常不伴有胃酸分泌增多？說到底，其實是因為賁門口松了的原因。至少是否與幽門螺桿菌感染有關，也并無明顯的相關性。