郭氏鑒于當時痧脹流行，采取前人有關經驗。于康熙十四年（1675年）撰寫《痧脹玉衡》一書共3卷，約7.9萬字。上卷，載痧癥發蒙論，玉衡要語列治痧三法，放痧有十、刮痧法、用針說、用藥大法等專論治痧方法，玉衡脈法列唇舌辨、痧脈十二經辨、痧脈要訣、痧脈有似陰證辨、痧脈似氣血有條辨、痧脈訣生死法等專論舌、脈診法。中卷，敘述臨床各種痧證的癥狀，并附以治療驗案，列遍身腫脹痧、傷風咳嗽痧，胎前產后痧、例經痧、眼目痧、瘟痧等45種。下卷，載述治痧方藥，共載湯、丸、丹、散劑56方，另載便用方7首、絕痧方和治痧藥物70余種。到康熙十七年（1678年）郭氏從臨床實踐中認識到“痧之變幻，更有隱伏于別病中者”，乃撰成后卷。后卷，載述了痧脹看法，痧脹兼證及變證，列麻疹兼痧脹、痧脹兼麻疹、痧類陰證、呃逆痧、盤腸痧、口舌兼痧、筋骨疼痛痧等醫學`教育網搜集整理37種。作者認為痧證之病因為天地間的戾氣，為熱毒之邪，可鄰里相傳。鄉村城市之中，俱有此證，或為悶痧、或為醫學`教育網搜集整理痧痛，類型繁多；傷寒、瘧疾、胎前、產后均可與痧兼發。痧毒自口鼻而入，或病于肌膚，或發于血肉，或發于胃腸經或肝脾腎三陰，均詳述了各種痧證的臨床癥狀和具體治療方法。該書羅列冗繁，使人有無證不痧之感，此為書中不足之處，但仍可稱之謂一部系統的痧證專著。