文章認為，中國一流研究生院代表中國最高學術水平，能夠就讀中國一流研究生院的A++級學科，將得到全國最好的專業教育。文章指出，研究生教育是創新教育，學生需要更多的時間與導師接觸。與大學相比，科研單位的師生比不高，在科研單位就讀研究生能得到導師更多時間的指導，滿足學生接觸導師的需要。因此，如果有條件，可以考慮到科研單位就讀研究生。

本年度中國一流研究生院的標準與上兩年相同，即：在中國研究生院評價中，獲得工學前7名、理學前4名、醫學前3名，農學前2名、管理學前3名、文學前3名、經濟學前2名、法學前2名、歷史學、教育學、哲學第1名的研究生院。中國一流研究生院各學科的入選數量根據各學科門的博士生導師數量和開設該學科的院校數量確定。

按照以上標準，在2005年我國405所大學、244個科研單位，共計649個研究生培養單位（不含軍事院校、不含主要為軍事工程服務的科研單位，不含第九批碩士點單位）中，有17所研究生院入選中國一流研究生院。一流研究生院的入圍數量和名單與上兩年完全相同，體現出中國一流研究生院具有穩定性。17所一流研究生院中，科研單位3個，大學13個，還有1個既是科研單位又是大學，就是中國醫學科學院又名中國協和醫科大學。

2005中國一流研究生院名單見下表。其中競爭最激烈的工學第三名被上海交通大學奪得，原第三名浙江大學降為第四名。

2005中國一流研究生院名單（共17所）