研究所的前身為中國科學院長沙農業現代化研究所，是中國科學院專門從事亞熱帶生態環境與區域農業研究的國立研究機構。
 
　　研究所主要研究方向為：農業生態系統格局與過程調控、畜牧健康養殖與農牧系統調控技術、作物耐逆境分子生態學機理及其品種選育。包括亞熱帶區域農業生態系統格局與發展模式、農業生態系統物質循環調控，作物耐逆境的分子生態學機理、耐逆境雜種優勢利用與品種選育、集約型養豬業產品健康與環境安全，亞熱帶農牧系統草食畜牧業健康養殖等創新研究內容。根據主要研究方向設置了三個研究中心，擁有院省共建的農業生態工程重點實驗室，分別在湖南桃源和廣西環江部署了兩個國家級野外生態試驗站。

　　研究所為碩士研究生提供600元/月的助學金，為博士研究生提供1000元/月的助學金，并為每位在讀研究生提供200元/月的研究助理津貼（第二學年起）；對研究生還提供中國科學院獎學金（1/4的學生可擇優享受450元/月的獎學金）；招收的研究生均為科學院公費。研究所導師隊伍強大，課題經費充足，科研設施完善，工作條件優越，研究生公寓條件舒適，園區環境優美，具有培養研究生的良好的科研、生活環境條件。

招生專業：生態學（博士和碩士點）、動物營養與飼料科學（碩士點）

學科、專業名稱：生態學    代碼：071012     招生人數：17名
研究方向	招生導師	考試科目
01區域生態學	王克林 陳洪松 曾馥平 肖潤林	①101政治②201英語③602高等數學（乙）或605普通化學（甲）④841生態學（乙）或835自然地理學或842土壤學
02 土壤與環境生態	吳金水 蘇以榮 黃道友	①101政治②201英語③602高等數學（乙）或605普通化學（甲）④841生態學（乙）或842土壤學或844植物營養學
03 生態系統過程與管理	謝永宏 魏文學 謝小立 李裕元	①101政治②201英語③602高等數學（乙）或605普通化學（甲）④841生態學（乙）或848植物生理學或840環境科學基礎（乙）
04 作物耐逆境分子生態學	夏新界	①101政治②201英語③610分子生物學④848植物生理學
05 作物耐逆境分子生態育種	肖國櫻	①101政治②201英語③610分子生物學④853遺傳學
06 種群生態學	王  勇	①101政治②201英語③602高等數學（乙）或609動物學④841生態學（乙）
學科、專業名稱：動物營養與飼料科學   代碼：090502   招生人數：7名
研究方向	招生導師	考試科目
01 單胃動物營養及分子生物學	印遇龍 黃瑞林 李麗立 *張友明 *張建社 *李愛科	①101政治②201英語③314數學（農）或315化學（農）④415動物生理學與生物化學
02 反芻動物生態營養	譚支良 *劉世民	同上